Фамилия Закамаркина — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранилось почти без изменений и при этом не имеет единственно верного толкования. В центре внимания здесь не корень, а суффикс и географическая привязка.

Словообразовательная модель ясна: основа «Закамарк» плюс суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?»). Мужской вариант — Закамаркин. Женское окончание -а здесь не меняет сути. Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Но вот что такое «закамарка»?

Самая вероятная версия отсылает к диалектному слову «закамарка» — так в некоторых говорах называли закоулок, глухое место, задворки, а также небольшую каморку или кладовку за печью. Человек мог получить прозвище Закамарка, если жил в отдалённой части деревни, в пристройке, или, что тоже возможно, был нелюдимым, «забитым» в угол. Менее распространённая, но лингвистически любопытная гипотеза связывает фамилию с архитектурным термином «закомара» — полукруглое завершение стены в древнерусском зодчестве. В этом случае «Закамарка» могло означать человека, жившего рядом с такой церковной постройкой или работавшего при ней.

География бытования фамилии подсказывает, что корни её — в северных и центральных областях России. Фамилия встречается в Вологодской, Архангельской, Костромской областях, где диалектное слово «закамарка» было в ходу, и где сохранилось много памятников древней архитектуры с закомарами. Важно, что это именно прозвищная фамилия, а не искусственная, семинарская: она не несёт книжного или церковнославянского налёта.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Закамарёв, Закамарский — показывает, что Закамаркина стоит особняком. Суффикс -ин здесь «прирос» к цельной основе, тогда как Закамарёв скорее образован от названия жителя определённого места (закамского, то есть за Камой). Закамаркина, таким образом, фамилия более конкретная, личная, прямо называющая человека по его бытовой или местной характеристике. Сословной привязки нет: носителями могли быть и крестьяне, и посадские люди, и священнослужители — прозвище не указывает на род занятий.