Фамилия Залубянин — редкий пример оттопонимического образования с суффиксом -янин, который в русских фамилиях встречается намного реже типовых -ов/-ев или -ин. Этот суффикс обычно указывает на принадлежность к определённой местности или жителю конкретного места (сравните: дворянин, рижанин, галичанин). В данном случае он прямо называет человека: «живущий за Лубянами».

Основа фамилии — топоним Лубяны (или Лубянка). Таких названий на Руси было немало: от деревень в бывшей Вятской губернии до урочищ в центральной России. Все они восходят к нарицательному луб — нижней, волокнистой части коры липы и других деревьев. Луб на Руси был стратегическим сырьём: из него драли мочало, плели лапти, корзины, короба, хлебницы и даже делали колыбели. Поэтому селения с корнем луб- часто возникали в лесных районах, где процветал соответствующий промысел — заготовка коры или изготовление лубяных изделий.

Приставка за- в фамилии выполняет пространственную роль. Человек получал прозвище Залубянин, если его двор или надел находился за пределами основного села Лубяны, за его околицей. Со временем это прозвище закрепилось как фамильное, перейдя от указания на место жительства к родовому имени.

В отличие от фамилий на -ский (Лубянский, Залубянский), которые чаще носили дворяне или духовенство, форма на -янин в фамилиях обычно бытовала в крестьянской и посадской среде. Она более архаична и указывает на прямое, неопосредованное прозвище, а не на искусственное образование по канцелярскому шаблону. Таким образом, предок носителя фамилии Залубянин, скорее всего, был крестьянином или ремесленником из общины, жившим на отшибе от основного поселения лубянщиков.