Фамилия Залюбченко — редкий случай, когда прозвище или имя-основа не очевидны на первый взгляд, а суффикс сразу указывает на географию. Это украинская фамилия, образованная по типичной для восточной и южной Украины модели: основа плюс суффикс -енко, который в XVI–XVIII веках означал «сын» или «потомок», а позже закрепился как фамильный.

Корень здесь — «Залюб-». Разбираем его: «за» и «люб». В русских и украинских говорах слово «залюба» или «залюбка» могло означать любимчика, баловня, того, кого «залюбили» до крайности. Но есть и другая, более правдоподобная версия: в основе лежит не прозвище, а неканоническое личное имя. В славянской традиции существовали имена-обереги, построенные на корне «люб»: Любим, Любко, Залюба. Имя Залюба могло даваться долгожданному или очень любимому ребёнку. Тогда Залюбченко — буквально «сын Залюбы».

Менее вероятно, но не исключено, что фамилия связана с топонимом. В Украине есть несколько сёл с названием Залюбень (например, на Львовщине). Переселенец из такого села мог получить прозвище Залюбченко — «тот, кто из Залюбеня». Однако суффикс -енко в топонимических фамилиях встречается реже, чем в патронимических, так что версия с именем-прозвищем выглядит убедительнее.

Фамилия почти не встречается за пределами Украины и русско-украинского пограничья, что подтверждает её местное происхождение. Носители Залюбченко — это потомки крестьян или казаков, потому что в среде дворянства и духовенства украинская модель на -енко практически не использовалась (там преобладали фамилии на -ский и -ов). Так что предки человека с этой фамилией, скорее всего, были свободными сельскими жителями или реестровыми казаками, которых записывали по отцу: «чей сын?» — «Залюбченко».