Фамилия Зайбенищев — редкий пример, где в основе лежит не имя, не ремесло и не географическое название, а глагольная форма, застывшая в прозвище. Разбираем её по частям: корень «зайб-» почти наверняка восходит к диалектному глаголу «зайбать» — ударить, стукнуть, а в некоторых говорах — сильно толкнуть или даже убить. Суффикс «-енищ-» здесь указывает на результат действия: «зайбенище» — то, что получилось в результате удара, или же человек, которого «зайбали», то есть избили, покалечили. Финальный «-ев» — стандартный патронимический суффикс, превращающий прозвище отца в фамилию сына.

Прозвище Зайбенище могло принадлежать человеку с заметным физическим недостатком — например, хромому или горбатому, чей облик напоминал о последствиях сильного удара. В крестьянской среде, где фамилии часто давались по внешним приметам, это было бы естественно. Менее вероятная, но возможная версия: прозвище относилось к драчуну или буяну, которого самого часто били, — тогда оно носило ироничный или предостерегающий оттенок. В любом случае, основа фамилии — не ласкательная и не книжная, а грубоватая, бытовая, характерная для северных и центральных русских говоров, где глагол «зайбать» фиксируется в диалектных словарях.

Географически фамилия крайне редкая и, скорее всего, локальная. Её носители могли происходить из одной волости или даже из одного села, где прозвище закрепилось за конкретной семьёй. В официальных переписях XIX века такие фамилии встречаются единично, чаще в среде государственных крестьян или однодворцев. Дворянских корней у Зайбенищева нет — суффикс «-ище» с увеличительным значением и просторечная основа исключают принадлежность к высшим сословиям.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Зайбин, Зайбенко, Зайбалов) показывает, что все они образованы от того же корня, но с разными суффиксами. «-енище» — один из самых редких вариантов, что делает фамилию Зайбенищев почти уникальной. Для её носителя это не просто фамилия, а прямое указание на прозвище предка, которое в XVI–XVII веках звучало как приговор внешности или характеру.