Фамилия Зайнилова — женская форма, а её мужской вариант — Зайнилов. Она тюркского происхождения и образована по русской модели с суффиксом -ов, который в XIX–XX веках адаптировал мусульманские фамилии под стандарты Российской империи. Основа фамилии — арабское имя Зайни, которое в переводе означает «красивый», «прекрасный» или «украшение». Полное арабское имя может звучать как Зайнулла (красота Аллаха) или Зайнаб (для женщин), но в тюркской среде имя Зайни часто давали в честь религиозного деятеля или просто как пожелание красоты.

С точки зрения словообразования, фамилия Зайнилов/Зайнилова — это патроним, то есть указание на отца по имени Зайни. Суффикс -ов здесь стандартный для русских фамилий, но в тюркских языках аналогом был бы суффикс -улы/-кызы. Появление фамилии именно в таком виде говорит о том, что предки носителей жили на территории, где русская администрация активно переписывала население и русифицировала фамилии — вероятно, в Поволжье, на Урале или в Закавказье.

Возможен и другой вариант: Зайнилова могла возникнуть от прозвища Зайнила, которое в некоторых тюркских диалектах означало «тот, кто любит украшения» или «щеголь». Однако это менее вероятно, так как имя Зайни встречается чаще. Фамилия не является редкой для татарской, башкирской или азербайджанской среды, но за пределами этих регионов почти не встречается.

Сословная принадлежность предков могла быть разной: от крестьян до мелких торговцев или духовных лиц. В метрических книгах XIX века Зайниловы фигурируют в основном среди мусульманских общин, где имя Зайни было популярным. Известных носителей фамилии в истории нет — это скорее фамилия простых людей, чья история осталась в архивах сельских советов.