Фамилия Зебоде редкая и, скорее всего, имеет немецкие корни. Её происхождение обычно связывают с прозвищем, которое описывало место жительства человека. Первая часть, «зе», восходит к верхненемецкому sē — «озеро». Вторая, «боде», происходит от нижненемецкого bōde — «маленький дом». Получается, что предок носителя этой фамилии мог жить в небольшом домике на берегу озера. Модель образования типична для немецких фамилий, описывающих жильё или ландшафт: два корня сливаются в одно слово-прозвище, которое затем закрепляется за родом.

Есть и другая версия: фамилия могла возникнуть от топонима. Речь идёт о местечке Зеебоден (нем. Seeboden) — ярмарочной коммуне в австрийской Каринтии, на берегу озера Милльштеттер-Зе. Если предок Зебоде был родом оттуда или служил в тех краях, фамилия просто указывала на его происхождение. Такое переосмысление названия в фамилию — обычное дело для немецкоязычных земель. Обратите внимание на написание: в фамилии нет удвоенной «е» (Seeboden → Zebode), что говорит о давнем бытовании в устной речи и возможном упрощении при записи.

Менее убедительна гипотеза, связывающая фамилию с арамейским именем Зеведей (Zebedeo), означающим «служитель бога Зеба». Эта версия вряд ли состоятельна, потому что арамейские имена в немецкой среде — исключительная редкость, и объяснить появление такого корня в фамилии без документальных подтверждений сложно. География фамилии не широкая, но её носители встречаются как в Германии, так и в России, куда она могла попасть с переселенцами в XVIII–XIX веках.