Фамилия Зеченкова — женская форма фамилии Зеченков, и её происхождение напрямую связано с мужским вариантом. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Зеченок, которое образовано с помощью уменьшительного суффикса -енок/-онок. В русских говорах, особенно северных и центральных, этот суффикс часто указывал на молодое существо или детёныша: волчонок, медвежонок, а в применении к человеку — на младшего члена семьи или подмастерья. Таким образом, Зеченок — это, скорее всего, «маленький Зек» или «сын Зека».

Корень «Зек-» в данном случае — самый интересный и неоднозначный. Вероятнее всего, он восходит к слову «зек» в значении «узник, арестант», которое широко вошло в обиход в советское время, но имеет более древнюю историю: в тюремном жаргоне XIX века «зек» — сокращение от «заключённый каторжанин». Однако фамилия Зеченков могла возникнуть и до массового распространения этого слова. В таком случае корень стоит искать в диалектных глаголах «зекать» (кричать, звать, подавать голос) или «зекнуть» (ударить, стукнуть). Прозвище Зек могли дать крикливому, голосистому человеку или, наоборот, тому, кто работал с резкими звуками, например, кузнецу или лесорубу.

Суффикс -ов в фамилии Зеченков указывает на типичную русскую модель образования от отчества: Зеченков буквально означает «сын Зеченка». Географически фамилия Зеченкова встречается в основном в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской, Тамбовской и Липецкой областях, что подтверждает её связь с южнорусскими говорами, где суффикс -енок особенно активен.

Есть и более редкая версия, связывающая фамилию с топонимом: в Псковской области существует деревня Зеченки, и фамилия могла произойти от названия местности, откуда был родом предок. Но учитывая, что фамилия не слишком распространена, версия с прозвищем остаётся основной. Так что предки человека с фамилией Зеченков — это, скорее всего, крестьяне или ремесленники из чернозёмных губерний, чей родоначальник получил прозвище за громкий голос, особый род занятий или, в более позднее время, по печальной жизненной ситуации.