Фамилия Жандикенова — редкий случай, когда географический и языковой анализ почти сразу даёт ответ, но с оговоркой. Корень здесь не славянский, а тюркский, и географически фамилия тяготеет к Казахстану и сопредельным регионам. Основа «Жандикен» — это, скорее всего, сложное слово, где первая часть «жан» (душа, человек, родной) широко распространена в казахском и других тюркских языках, а вторая часть «дикен» может восходить к «дикен» (колючка, сорняк) или к имени «Дикен» (уменьшительная форма от Динмухаммед, например). Есть и более прозаичная версия: «Жандыкен» — это ойконим, название населённого пункта, например, аула или зимовья, где жили предки.

Суффикс «-ова» указывает на принадлежность: Жандикенова — это «дочь/жена человека по прозвищу или имени Жандикен». В русской традиции оформления тюркских фамилий в XIX–XX веках такой суффикс добавляли для адаптации к паспортной системе. Если фамилия мужская — Жандикенов, то женская форма закрепилась как Жандикенова.

Что касается прозвища: если «жандикен» понимать буквально как «душа-колючка», это могло быть ироничное или ласковое прозвище человека с непростым характером — колючего внешне, но душевного внутри. В казахской среде такие составные прозвища с компонентом «жан» не редкость: Жанболат, Жангельды. Однако «дикен» в этом контексте встречается реже, что делает фамилию локальной, возможно, связанной с одним родом или жузом.

Сравнение с однокоренными фамилиями (вроде Жандикенов, Жандикен, Дикенов) показывает, что вариант с суффиксом «-ова» — самый частый в документах, но сама фамилия остаётся малочисленной. В переписях населения встречается эпизодически, в основном в Северном и Центральном Казахстане. Спорных версий, кроме указанных, практически нет: корень прозрачен, а тюркская этимология не вызывает сомнений.