Фамилия Жандырова — редкий пример, в котором основа почти наверняка не славянская, а тюркская. Если отбросить суффикс -ов, указывающий на принадлежность (чьи? — Жандыровы), то корень «Жандыр» не встречается в древнерусских именах и прозвищах. Наиболее вероятная версия ведет к тюркскому слову «жандыр» — «гореть», «жечь», «опалять». В казахском, башкирском и татарском языках «жандыру» означает «зажигать», «воспламенять». Прозвище Жандыр могли дать человеку с горячим, вспыльчивым нравом, либо тому, кто занимался обжигом угля, глины или выжиганием леса под пашню.

Суффикс -ов типичен для русской фамильной модели, но сама основа указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русскоязычной среде. Скорее всего, предок носителя фамилии был тюркоязычным (татарином, башкиром, казахом), который попал в русское подданство или жил в смешанном регионе, и его прозвище записали на русский лад. В пользу этого говорит и характерное для тюркских языков начальное «ж», которое в русских фамилиях встречается редко и почти всегда связано с заимствованиями.

Географически фамилия Жандырова тяготеет к Поволжью, Приуралью и южным областям России — местам, где издавна соседствовали славянские и тюркские народы. Встречается она нечасто, что подтверждает её локальное, а не общерусское происхождение.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с арабским именем Жандар (или Зандар), которое могло попасть в тюркскую среду через ислам. Однако фонетика «жандыр» ближе к глагольной форме, чем к имени, поэтому версия с прозвищем по роду деятельности или характеру выглядит убедительнее. Фамилия не имеет отношения к русским словам «жандарм» или «жанр» — это случайное звуковое совпадение.