Фамилия Жангунисова образована от мужского имени Жангунис, и её разумнее всего анализировать, начав с разбора этой исходной основы. Имя Жангунис — составное, типичное для тюркской антропонимической традиции, где два корня сливаются в одно прозвище или личное имя. Первая часть, Жан, восходит к тюркскому «джан» — «душа», «близкий человек», широко распространённому в именах и обращениях от Кавказа до Средней Азии. Вторая часть, Гунис, сложнее. Самая вероятная версия — она происходит от тюркского корня «гюн» («день, солнце, свет»), и тогда имя Жангунис означает «светлая душа», что звучит как благопожелание. Есть и альтернативная гипотеза, связывающая Гунис с монгольским «kuni» — «баран». В древности считалось, что человек, носящий имя с «душой» животного, перенимает его качества — выносливость или упорство, поэтому такие имена не воспринимались как обидные.

Фамилия оформлена по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который присоединяется к основе на согласный. Притяжательный суффикс -ов(-а) указывает на принадлежность: Жангунисова — буквально «дочь (или жена) Жангуниса». Окончание -а выдаёт женскую форму, тогда как мужской вариант — Жангунисов. Такая модель фамилий типична для народов, долгое время живших в контакте с русским языком и принявших его паспортную систему в XIX–XX веках.

Географически фамилия редкая и тяготеет к регионам, где пересекались тюркские и монгольские языковые влияния — например, к Северному Кавказу, Поволжью или Казахстану. Учитывая составные части имени, предки носителя фамилии могли быть из среды, где сохранялись добуддийские или доисламские верования, допускавшие «звериные» имена. Процесс закрепления фамилий был длительным и неравномерным, поэтому точно установить место и время возникновения рода Жангунисовых можно только на основе углублённых генеалогических изысканий.