Фамилия Жантохов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа, «Жантох», почти наверняка не славянского происхождения, и это сразу выделяет фамилию из ряда типичных русских фамилий на -ов.

Скорее всего, Жантохов — это русифицированная версия фамилии, восходящей к тюркским или кавказским корням. Можно предположить, что в основе лежит личное имя или прозвище Жантох. Первая часть «жан» (джан) в тюркских и иранских языках означает «душа», «любимый», «дорогой». Вторая часть «тох» может быть вариантом тюркского «ток» — «сытый», «обильный», или же восходить к арабскому «таухид» (единобожие), но в сокращённой, просторечной форме. Таким образом, исходное прозвище могло означать «сладкая душа», «дорогой и сытый» или нечто подобное — ласкательное имя, которое дали человеку за характер или внешность.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия была адаптирована русской административной или церковной средой. Это типичная модель для XVI–XIX веков, когда нерусское население империи получало фамилии по отцу: «чей сын?» — «Жантохов», то есть сын Жантоха. Географически фамилия могла возникнуть в регионах с тюркским или кавказским населением, которое переходило в православие или активно контактировало с русскими — например, на Северном Кавказе, в Поволжье или в Закавказье.

Словообразовательная модель проста: корень Жантох- + суффикс -ов. Вариант с суффиксом -ев (Жантохев) маловероятен, так как основа не заканчивается на мягкий согласный или ц. Фамилия не склоняется по женскому роду в разговорной речи, но в официальных документах женская форма — Жантохова.

Сословное происхождение определить трудно: носителями могли быть как крестьяне, так и казаки или мелкие служилые люди, получившие фамилию при переписи. Известных исторических личностей с такой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что подтверждает её редкость. Сегодня Жантоховы встречаются точечно, преимущественно на юге России и в странах бывшего СССР.