Фамилия Жавхойдарова — редкий пример фамилии, образованной от полного арабского имени, а не от прозвища или профессии. Её основа — мужское имя Жавхойдар, которое восходит к арабскому Джавхар (جَوْهَر), что означает «драгоценный камень» или «жемчужина». Суффикс -ов- типичен для русской модели фамилий, указывающей на принадлежность: Жавхойдарова буквально значит «дочь/жена Жавхойдара». Форма на -а — женская, мужской вариант — Жавхойдаров.

Само имя Жавхойдар — это, скорее всего, диалектный или фонетически изменённый вариант более распространённого в исламском мире имени Джавхар. В русской транскрипции арабские звуки часто передавались неточно, особенно в регионах, где письменная фиксация велась через тюркские языки. Поэтому Жавхойдар — не ошибка, а живая народная форма, закрепившаяся в документах.

Географически фамилия указывает на Северный Кавказ или Поволжье — регионы, где исламские имена активно входили в русский именослов через посредство тюркских языков. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном происхождении: возможно, она принадлежала одной семье или роду, переселившемуся в русскоязычную среду в XIX–XX веках.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ов, образованных от прозвищ или профессий, Жавхойдарова — «именная» фамилия, то есть напрямую указывает на личное имя предка. Это сближает её с такими фамилиями, как Ахмедов или Ибрагимов, но выделяет редкостью самой основы. По сословной принадлежности носители могли быть крестьянами или горожанами, но точных данных нет — фамилия не фиксируется в дворянских родословных книгах.

Другой версии происхождения, кроме как от арабского «драгоценный камень», для этой фамилии нет. Вариант, что основа — тюркское слово, маловероятен: ни в одном тюркском языке нет корня «жавхойд» со значением, подходящим для прозвища. Так что арабское имя — единственное обоснованное объяснение.