Фамилия Женунтий — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не прозвище, а напрямую церковный календарь. Это не что иное, как русифицированная форма канонического имени Зиновий (от греческого Зенон — «божественный», «посвящённый Зевсу»). В святцах имя встречается в форме Зиновий, но в народном произношении, особенно в южнорусских и украинских говорах, оно могло трансформироваться в Женунтий через замену начального «з» на «ж» (явление, распространённое в диалектах) и переосмысление окончания на «-ий» в более привычное «-унтий», которое звучало как типичное церковное имя (ср. Минуций, Терентий). Таким образом, Женунтий — это не самостоятельное имя, а его обиходный вариант.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Фамилия оформлена суффиксом -ий, что для русской фамильной системы редкость: обычно такие окончания характерны для украинских фамилий (Женунтий) или для искусственных семинарских фамилий, образованных от латинизированных форм имён. Однако в данном случае, скорее всего, перед нами не искусственная, а народная фамилия, возникшая из прямого использования имени в качестве прозвища: человека звали Женунтием (в быту), и это имя закрепилось за его потомками без добавления типичных суффиксов -ов или -ин. Такое возможно в среде, где фамилии ещё не устоялись, или в малограмотной среде, где отчество или прозвище записывали как есть.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям, где мягкое «ж» и трансформация «з» в «ж» — обычное дело. Встречается она крайне редко, в основном в единичных записях. По сословной принадлежности предки Женунтиев — скорее всего, крестьяне или мещане, а не духовенство, так как семинарские фамилии обычно более «книжные» (Зиновьевский, например). Здесь же — след живой речи, где имя переделали по законам удобства произношения.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилии Зиновьев, Зинович, Зиньковский — распространены и понятны, а Женунтий стоит особняком. Это не ошибка писаря, а свидетельство того, как имя «обросло» местным говором. Единственная версия, которая может конкурировать, — происхождение от редкого прозвища Женуня (от «жена»), но она слаба: суффикс -унтий не типичен для прозвищ, а имя Зиновий даёт более логичную и подтверждённую аналогию.