Фамилия Жермунец — редкая и географически привязанная. Её основа — топоним, а не прозвище или профессия. Скорее всего, она происходит от названия населённого пункта вроде Жермуны или Жермунь, а суффикс -ец указывает на выходца оттуда («жермунский» человек). Такая модель типична для западных регионов бывшей Речи Посполитой: в польской и белорусской ономастике фамилии на -ец часто обозначали уроженца конкретного места.

Корень «жермун-» тёмный. Вероятнее всего, он балтского или ятвяжского происхождения. В литовском языке есть слово žirgas (конь) и žirmas (серый, сивый), но прямой связи с «жермун» нет. Ближе стоит прусское *germuns — «тёплый» или старопрусские топонимы с основой girm- (лес, чаща). Если это так, то Жермунец — человек из лесистой или тёплой местности, хотя точное значение утрачено.

Фамилия почти не встречается в центральной России. Её ареал — Гродненская и Брестская области Беларуси, а также приграничные районы Польши и Литвы. Носители Жермунец — потомки крестьян или мелкой шляхты, которые в XIX веке получили фамилию по месту жительства при переписях. Дворянского герба или титула за этой фамилией не зафиксировано: суффикс -ец в польской традиции чаще давали простым людям, в отличие от -ский у знати.

В написании возможны варианты: Жермунец, Żermuniec (польская запись) или Žermunec (литовская). Ударение падает на второй слог: Жерму́нец. Встречается искажённая форма Жермунцев, но она вторична — появилась под влиянием русских фамилий на -ов в советских документах. Исконная форма без суффикса -ов сохранилась у потомков, которые не уехали далеко от родового гнезда.