Фамилия Жологопенко — редкий случай, когда основа прозвища спорна и неочевидна, а суффикс указывает на чёткое происхождение. Типичный украинский патроним на -енко («сын» или «потомок») говорит о том, что предок носителя фамилии был известен под прозвищем Жологоп или Жолоп. Вопрос в том, что это за слово.

Первая и самая вероятная версия — фонетическое искажение слова «желтопоп» или «жолтопоп»: от украинского «жовтий» (жёлтый) и «поп» (священник). Прозвище Жёлтый Поп могло закрепиться за светловолосым или рыжеватым священником, либо за человеком, носившим жёлтую рясу (определённый чин или епархия). В устной речи «жовтопоп» могло стянуться до «жолоп», а затем обрасти суффиксом -енко. Фонетика «жо-» вместо «же-» характерна для юго-западных говоров Украины.

Вторая версия — связь с диалектным словом «жолоп» или «жолоб», означавшим «желоб», «лощина», «овраг». В этом случае прозвище давали по месту жительства: человек, живший у оврага или в низине. Однако слово «жолоп» в значении «овраг» встречается редко, и без дополнительных говоров эта гипотеза слабее.

Третья, маловероятная гипотеза — связь с грубым ругательством «жолоп» (невежа, болван). Такие прозвища давали не в прямом значении, а в ироничном или охранительном смысле — чтобы отвести сглаз. Но в украинской антропонимии прозвища с явно негативной окраской встречаются реже, чем нейтральные или профессиональные.

Фамилия Жологопенко практически не встречается за пределами Украины. Её можно найти в реестрах Черниговской, Полтавской и Сумской областей — именно там были распространены прозвища, связанные с духовенством, и фамилии на -енко. Писарская ошибка в написании (через «о» вместо «е») могла закрепиться в документах уже в XVIII–XIX веках, когда фамилии фиксировались на слух.

Таким образом, носитель фамилии Жологопенко с высокой вероятностью — потомок человека, которого в округе звали Жёлтым Попом, либо выходца из места с названием вроде Жолоб или Жолоп.