Фамилия Зикрацкий напрямую связана с местом, где жили или откуда были родом её первые носители. В основе фамилии лежит название села Зикранцы, которое находится в Семеновском районе Полтавской области Украины. Такая модель образования — по названию местности с помощью суффикса -цк(ий) — одна из древнейших в славянской традиции. Она указывает, что предок человека с фамилией Зикрацкий был выходцем из этого села или долгое время там проживал.

Существует и другая, менее вероятная версия. Она связывает фамилию с украинским глаголом «зикати» — «громко кричать». В этом случае Зикрацким могли прозвать либо крикливого ребёнка, либо взрослого человека с громким, звучным голосом. Однако топонимическое происхождение выглядит более убедительным: фамилии на -ский/-цкий в подавляющем большинстве случаев образовывались именно от географических названий, а не от прозвищ по характеру.

Точное время возникновения фамилии Зикрацкий установить сложно. Процесс формирования фамилий у славян растянулся на несколько столетий, и оседание конкретного прозвища в виде наследственного родового имени могло произойти в разное время. Тем не менее, сама фамилия сохранила память о небольшом полтавском селе, которое дало ей начало.