Фамилия Зинонова — женская форма, мужской вариант — Зинонов. В её основе почти наверняка лежит нецерковное имя или прозвище Зинон, которое, в свою очередь, восходит к греческому Зенон (Ζήνων) — «посвящённый Зевсу». В русской традиции это имя встречалось редко, чаще в монашеской среде, но могло бытовать и в крестьянских семьях как редкое крестильное имя, данное в честь святого Зинона (например, Зинона Веронского или Зинона Финикийского).

Модель образования проста: суффикс -ов (в женском варианте -ова) присоединялся к основе Зинон, указывая на принадлежность: «чей?» — Зинонов, то есть сын или потомок Зинона. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Зино́нова, хотя в разговорной речи возможны варианты.

Географически фамилия редкая и локальная. В дореволюционных списках и современных базах она встречается точечно, преимущественно в центральных и северных областях России — в Вологодской, Костромской, Ярославской губерниях. Там, где фамилии на -ов были основным типом для крестьянства, Зинонов мог закрепиться за одним родом в конкретной деревне. Встречается также вариант с двойным «н» — Зиннонов, но это скорее описка или результат народной этимологии.

Если отбросить версию с редким крестильным именем, остаётся прозвищная: Зиноном могли прозвать человека с каким-то ярким качеством, связанным с корнем «зной» или «зиять» (например, крикливого или горячего), но это уже область догадок. Научного подтверждения такая связь не имеет, поэтому основная и самая правдоподобная версия — от имени Зинон.

Интересная деталь: фамилия Зинонов встречается в документах XVII века среди служилых людей (детей боярских) на южных рубежах России, но это единичные случаи. В целом носители фамилии — потомки крестьян или мещан, и редкий корень делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если у вас фамилия Зинонова, скорее всего, все её носители в России — родственники в пределах нескольких столетий.