Фамилия Зинюшкин образована по редкой и выразительной модели: суффикс -ушкин указывает на принадлежность к человеку по имени или прозвищу, оканчивающемуся на -уша или -юша. В основе лежит имя Зиня — уменьшительная форма от канонического имени Зиновий (греч. Зиновиос — «живущий богоугодно»). Такие «домашние» имена, как Зиня, в быту почти вытесняли полное церковное имя, а суффикс -ушкин образовывал фамилию по схеме «чей?»: Зинюшкин буквально значит «сын Зинюшки», то есть человека, которого ласково звали Зиня.

Словообразовательная цепочка здесь необычна: не Зиня → Зинькин (с суффиксом -ин), а Зиня → Зинюшка → Зинюшкин. Суффикс -ушк- вносил оттенок ласкательности, так что фамилия могла закрепиться за ребёнком или младшим членом семьи, которого называли Зинюшкой. В русских говорах встречается и вариант Зинушкин — от Зинушка, но Зинюшкин звучит более архаично и могло бытовать в северных и центральных областях, где любили «усечённые» формы имён.

Вторая, менее вероятная версия связывает основу с диалектным словом «зиня» — так в некоторых регионах называли ротозея, разиню. Прозвище Зиня мог получить рассеянный или медлительный человек, и от него по той же модели возникла фамилия. Однако ономастический словарь Б. Унбегауна и работы В. Никонова показывают, что подавляющее большинство фамилий на -ушкин восходят к личным именам, а не к нарицательным прозвищам, поэтому версия с именем Зиновий предпочтительнее.

Фамилия редкая: в современных справочниках она не упоминается среди массовых, и её носители встречаются точечно — в основном на западе России и в Поволжье. По сословному составу предки Зинюшкиных, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии на -ушкин типичны для непривилегированных слоёв, где сохранялись живые, неофициальные формы имён. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Написание с буквой Ю после З (Зинюшкин, а не Зинушкин) — ещё одна деталь, отличающая фамилию от однокоренных. В старых документах встречается написание Зинюшкын, но современная орфография закрепила вариант с И. Если ваш предок носил эту фамилию, можно с высокой долей уверенности предположить, что его звали Зиновий, а в семье — ласково Зиня или Зинюшка.