Фамилия Зирдзинин — редкая, с неочевидной для русского уха основой. Если отбросить типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность (буквально «чей?» — сын или потомок Зирдзина), остаётся корень «Зирдз-». Именно он и требует разбора.

Первое, что бросается в глаза: сочетание «дз» нетипично для исконно русских слов, но характерно для польского, белорусского, украинского и отчасти литовского языков. Скорее всего, в основе лежит прозвище или имя Зирдзя (Зирдзь). В польском языке есть слово «żyrzdzić» (в старой орфографии могло писаться через «z») — «медлить, копаться, возиться». Прозвище Зирдзя могли дать человеку неторопливому, основательному или, наоборот, нерасторопному. Менее вероятна, но возможна связь с литовским «žirgas» (конь, жеребец) через диалектные формы — тогда прозвище могло относиться к конюху или всаднику.

Суффикс -ин в фамилии Зирдзинин указывает на восточнославянскую модель образования. Это значит, что предок носителя фамилии был известен в своей общине как Зирдзя — по прозвищу или некалендарному имени. Такие фамилии чаще всего встречались в северных и центральных губерниях России, а также в белорусских и смоленских землях, где польское и литовское влияние оставило след в лексике.

Учитывая редкость фамилии, её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких соседних родов. Сословная принадлежность могла быть разной: от крестьян до мещан, но в любом случае фамилия закрепилась не позднее XVIII — первой половины XIX века, когда происходила массовая фиксация прозвищ в официальные фамилии. Спорных версий здесь немного — корень настолько специфичен, что основные гипотезы сводятся к двум: либо польское «медлительный», либо балтское «конный». Первая версия выглядит убедительнее из-за наличия в польском языке глагола с подходящей фонетикой.