Фамилия Злапупукин — случай, где прозвище перевешивает имя, а народная шутка закрепляется в документе. В её основе лежит не имя Злата и не церковное слово «злато», а сложное прозвище Зла (или Злой) Пупук. Первая часть — прилагательное «злой» (в древнерусском — «зълъ»), вторая — «пупук». Пупук — это народное название удода, птицы с хохолком и характерным криком. В русских говорах так могли прозвать человека за взъерошенный вид, нелепую походку или склонность к суете. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Злапупукин буквально значит «сын Злого Пупука», то есть потомок человека, которого дразнили злым удодом.

Фамилия редкая, её география практически не зафиксирована в массовых списках XIX века. Вероятнее всего, она возникла в среде однодворцев или крестьян южнорусских губерний, где диалектное «пупук» было в ходу, а прозвища с определением «злой» давали не столько за характер, сколько за нелюдимость или вспыльчивость. В отличие от фамилий на -ский или -ов, модель на -ин здесь нестандартна: основа не имя (Иван — Иванов), а прозвище с прилагательным впереди. Сравните с фамилиями Злодеев, Злобин — но у Злапупукина двойная основа, что редкость для русской антропонимии.

Версия о происхождении от имени Златопупа (якобы «золотой пуп») маловероятна: в древнерусской ономастике нет ни одного подтверждённого случая такого имени. Скорее всего, это позднее осмысление, когда непонятное слово «пупук» народная этимология переделала в «пупок». Но в документах XVI–XVII веков, если бы фамилия существовала, она писалась бы через «у», а не через «о»: Злапупук, а не Злапопок. Так что перед нами не ласкательное прозвище, а меткое насмешливое — злой удод.

Носителей фамилии крайне мало. В современных телефонных справочниках и базах Злапупукины встречаются единично, в основном на Урале и в Сибири, куда переселенцы могли принести прозвище из центральных губерний. Фамилия не дворянская, не купеческая — чисто крестьянская, с ярким отпечатком бытовой наблюдательности.