Фамилия Змерега — редкая и звучит необычно для русского уха. Её происхождение, скорее всего, связано не с русским, а с украинским или белорусским языком, где есть слово «змій» (змей) или «змія» (змея). Основа фамилии — «змерег» — может быть диалектным вариантом слова «змеегрыз» или «змей-горе», но более прозаичная версия ведёт к прозвищу Змерега, которое давали человеку с извилистым, скользким характером, либо тому, кто ловил змей или знался с ними (например, знахарю-змеелову). Суффикс -ега в украинских и белорусских фамилиях встречается редко и часто указывает на прозвищное происхождение, как в фамилиях Деревяга, Бородага.

Словообразовательная модель проста: основа «змерег-» + окончание -а. Такие фамилии на -а обычно закреплялись в форме именительного падежа и не склонялись по типу притяжательных (как Змерегов). Это говорит о том, что фамилия могла возникнуть в среде, где ещё не сформировалась стандартная модель на -ов/-ин — например, у запорожских казаков или в сёлах Полесья. Встречаемость фамилии крайне низкая: по открытым данным, Змерега фиксируется в основном на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси. В России носители единичны.

Есть и вторая, менее убедительная версия: связь с польским словом «zmierzchać» (смеркаться) — мол, Змерега — это «сумеречный человек». Но фонетически переход «змьержх» в «змерэг» маловероятен, а прозвище от «змеи» звучит естественнее. В любом случае, фамилия Змерега — яркий пример того, как прозвище, данное по внешней или поведенческой черте, превратилось в родовое имя.