Фамилия Зотовигорь — редкий пример двухосновной русской фамилии, где к личному имени присоединили топонимическую часть. В ней легко угадываются два корня: «Зот» и «гор». Первая часть восходит к каноническому имени Зот (разговорная форма от Зотик, Зотикей, в крещении — Зосима). Вторая часть — «горь» — указывает на гору, возвышенность или, в переносном смысле, на жителя гористой местности.

По модели образования фамилия Зотовигорь стоит ближе к двойным фамилиям дворянского или полуофициального происхождения (вроде Римский-Корсаков, Голенищев-Кутузов), но с той разницей, что вторая часть здесь не фамильная, а прозвищная или географическая. Скорее всего, фамилию дали для различения однофамильцев: в селе или городке жило несколько Зотовых, и одного из них, жившего у горы или на горе, прозвали Зотов-горь, то есть «Зотов с горы». Со временем дефис исчез, и написание слилось в Зотовигорь.

Нельзя исключать и версию, что «горь» — это не гора, а искажённое прозвище «Горя» (от горе, горевать), но она маловероятна: в русской ономастике сочетание личного имени с прозвищем в такой конструкции встречается редко, а вот привязка к месту жительства — типичный приём. Кроме того, в говорах северных и центральных губерний слово «горь» могло означать не только возвышенность, но и «верхнюю часть села», «крайний двор на взгорке».

Фамилия Зотовигорь почти не встречается в современных справочниках массовых фамилий. Она могла возникнуть в среде однодворцев или казачества, где практика двойных прозвищ была распространена, или в купеческой среде, где стремились к благозвучным и отличительным фамилиям. Учитывая редкость, носители этой фамилии, скорее всего, происходят из одной локальной группы — возможно, из южнорусских или поволжских областей, где фамилии на «-гор» (Горский, Горев) встречаются чаще, чем на севере.