Фамилия Зуайтер — редкий пример фамилии, которая не вписывается в привычные славянские модели на -ов, -ин или -ский. Её основа и суффикс указывают на иное, нерусское происхождение, и для её понимания нужно смотреть в сторону немецкого или еврейского (ашкеназского) корня.

Скорее всего, Зуайтер — это вариант передачи немецкой фамилии Sauter или Seuter. В немецком языке Sauter — одна из форм профессии «портной» (Schneider), но более точная этимология восходит к средневерхненемецкому sūtaere, «швец», «тот, кто шьёт». Другая возможная основа — диалектное Seuter, «бродячий торговец» или «коробейник». Оба значения вполне могли стать прозвищем, а затем и фамилией. Суффикс -ер в немецких фамилиях — самый распространённый показатель профессии или деятеля (как -тель в русском).

Написание с буквой «З» в начале — результат адаптации к русской графике: немецкое S в начале слова перед гласной передаётся как «з». Второй вариант, Зойтер, тоже встречается, но Зуайтер — более точная передача произношения в некоторых южнонемецких диалектах, где дифтонг au читается близко к русскому «уа».

Географически фамилия могла прийти на территорию Российской империи вместе с немецкими колонистами, которых приглашали Екатерина II и Александр I. Немцы-колонисты селились в Поволжье, на юге Украины, в Закавказье. Среди них было много ремесленников, в том числе портных и сапожников. Не исключено и еврейское происхождение: среди ашкеназов фамилия Sauter (или Zauter) также фиксируется, особенно в Германии и Австрии, и могла быть записана при переходе на русский язык как Зуайтер.

В современной России фамилия остаётся очень редкой. Её носители — потомки тех самых переселенцев, которые сохранили фамильное прозвище предка-ремесленника. В отличие от массовых русских фамилий, Зуайтер не даёт привязки к отчеству или месту, но зато прямо указывает на занятие: ваш предок, скорее всего, шил одежду или торговал вразнос.