Фамилия Зубоваткин — редкий случай, когда в основе лежит не простое прозвище, а сложное, составное слово. Разберём её по частям.

Корень здесь — «зуб». Это одна из самых распространённых основ в русских фамилиях (Зубов, Зубарев, Зубатый, Зубков). Но в нашем случае к нему добавилась вторая часть — «ватка». Скорее всего, это не уменьшительное от «вата», а искажённое диалектное «вадька» или «вадка», что в некоторых говорах означало «ссора», «вражда» или «обида». Выходит, исходное прозвище Зубоватка (или Зубовад) могли дать человеку злому, сварливому, «зубастому» на язык — тому, кто постоянно затевает ссоры и помнит обиды.

Суффикс -кин указывает на принадлежность: Зубоваткин буквально значит «сын Зубоватки». Модель образования типична для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин и -кин особенно часты. Обратите внимание на то, что в фамилии сохранилась соединительная гласная «о» — это говорит о том, что прозвище сложилось как полноценное двукоренное слово (как Безбородкин или Черномордин), а не как простое производное.

Поскольку фамилия очень редкая, её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких соседних сёл. В дореволюционных переписях такие «сложные» фамилии часто возникали в среде государственных крестьян или однодворцев — людей, которые жили обособленно и давали друг другу меткие, не всегда лестные прозвища. Ваш предок, видимо, был человеком с непростым характером, и эта черта закрепилась в фамилии на века.

Сравните с однокоренными, но более простыми фамилиями: Зубов (от «зуб» как часть тела или прозвище силача), Зубарев (от названия рыбы или профессии), Зубаткин (от рыбы зубатка). Зубоваткин стоит особняком — это не профессиональное и не тотемическое прозвище, а чисто бытовая, психологическая характеристика.