Фамилия Зузеева — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с диалектным глаголом, а не с именем или профессией. В русских говорах «зузеть» означало «ныть, плакать, капризничать» или, в других областях, «зудеть, надоедать». Соответственно, Зузей — прозвище капризного, плаксивого или назойливого человека. Такая модель образования — от глагольной основы с суффиксом -ей — типична для прозвищ по характеру (ср. Воробей, Грамотей, Соловей).

Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Зузеев — сын Зузея. Форма женского рода Зузеева, таким образом, означает «дочь или жена Зузея». Фамилия закрепилась в форме притяжательного прилагательного, что характерно для русского ономастикона XVI–XVII веков, когда основная масса крестьян и посадских людей получала фамилии по отцу.

Интересно, что корень «зуз-» встречается не только в глагольном значении. В некоторых диалектах «зуза» — это «непоседа», «егоза», а в южнорусских говорах так могли называть человека с невнятной, шепелявой речью. Поэтому нельзя исключать, что прозвище относилось не к характеру, а к манере говорить. Однако связь с плаксивостью или нытьём поддерживается устойчивым фольклорным оборотом «зузить» — докучать.

Фамилия однозначно русская, но географически редкая. Основные очаги её бытования — Пензенская область и прилегающие районы Среднего Поволжья, а также отдельные сёла в Свердловской области. Это указывает на то, что фамилия возникла не в центральных губерниях, а в зоне позднего заселения, куда предки переселились уже с готовым родовым именем.

С точки зрения словообразования, Зузеева стоит в ряду фамилий, образованных от прозвищ с суффиксом -ей/-ай, которые часто фиксировали внешнюю или внутреннюю черту человека. В отличие от фамилий на -ов/-ин от крестильных имён, такие прозвища давали не при крещении, а в быту — и они могли быть нелестными. Впрочем, для XVI–XVII веков прямота прозвища не считалась оскорблением: Зузей мог быть просто человеком, который часто жаловался или капризничал, и это становилось его отличительным признаком.