Фамилия Зыблиенко образована по той же модели, что и тысячи других украинских фамилий на -енко. Суффикс -енко в буквальном смысле означает «маленький», «сын» или «потомок». То есть Зыблиенко — это, по сути, «сын Зыблого» или «потомок Зыблы». Сама основа Зыбл- восходит к прозвищу или мирскому имени, которое дали человеку с характерной внешностью или поведением.

Корень фамилии — «зыбь», «зыбкий». В русских и украинских говорах «зыблый» означало неустойчивый, шаткий, колеблющийся. Такое прозвище могли дать человеку нетвёрдой походки, сутулому, либо тому, кто часто менял решения, был непостоянным в делах. В переносном смысле — «зыбкий человек», на которого трудно положиться. Однако не стоит сразу искать негативный оттенок: в старину прозвища давали без злого умысла, просто фиксируя бросающуюся в глаза черту.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В некоторых диалектах «зыбка» — это колыбель, люлька. Тогда Зыблиенко могло означать «сын того, кто делает зыбки» (мастер-колыбельщик) или «сын того, кого качали в зыбке» — то есть младший, поздний ребёнок в семье. Эта версия менее вероятна, потому что прозвище Зыблый встречается в документах чаще, чем прозвище Зыбка, но полностью исключать её нельзя.

Фамилия распространена в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской, Полтавской и Киевской губерниях. Связано это с тем, что суффикс -енко наиболее типичен для Поднепровья. В России Зыблиенко встречается редко и, как правило, в среде потомков переселенцев с Украины конца XIX — начала XX века. По сословной принадлежности предки носителя фамилии почти наверняка были крестьянами или казаками, так как фамилии на -енко редко встречались у дворянства.

Сравните с однокоренными фамилиями: Зыблев (русская версия, с суффиксом принадлежности -ев), Зыблый (прямое прозвище, ставшее фамилией) и Зыбко (украинская фамилия с другим суффиксом). Все они указывают на один и тот же корень, но Зыблиенко — самая молодая по форме, типичная для украинской антропонимии XVII–XVIII веков, когда фамилии на -енко стали массово оформляться у простого люда.