Фамилия Зюзенкова — женская форма, а мужская, Зюзенков, образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или имени через суффикс -ов. В основе лежит слово «зюзя» или «зюза». В русских говорах, особенно смоленских, псковских и тверских, «зюзя» — это не только прозвище плаксы, нытика или неопрятного, вечно мокрого человека, но и диалектное название грязи, слякоти. В словаре Даля «зюзя» — «мокрый, вымокший до нитки», а глагол «зюзюкать» означал «плакать, хныкать». Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище Зюзя за привычку жаловаться, либо за то, что вечно ходил промокшим и чумазым.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с украинским или белорусским «зюзя» в значении «зяблик» (птица). В таком случае прозвище могло относиться к человеку небольшого роста или зябкому, мерзлявому. Однако географическое распространение фамилии указывает скорее на северо-западные и центральные области России, где преобладает «мокрое» значение.

Суффикс -енк- в основе Зюзенков — уменьшительно-уничижительный, характерный для прозвищ. Он мог смягчать грубость исходного слова: Зюзенок — это «маленький зюзя», то есть не столько осуждаемая черта, сколько дразнилка для ребёнка или младшего в семье. В XVI–XVII веках такие прозвища легко становились фамилиями, закрепляясь за потомками. В документах встречаются однокоренные фамилии: Зюзин, Зюзев, Зюзгин — все они восходят к тому же корню, но Зюзенков выделяется именно уменьшительным оттенком.

Если искать социальный контекст, то носители фамилии Зюзенковы в большинстве своём были крестьянами или посадскими людьми. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — прозвище слишком бытовое и неблагозвучное для аристократии. В переписях XIX века Зюзенковы чаще всего встречаются в Рязанской, Тамбовской и Владимирской губерниях, что подтверждает народное, а не книжное происхождение.

У фамилии нет спорных версий, которые стоило бы долго разбирать: корень ясен, прозвищная природа очевидна. Единственное, что стоит отметить — написание через «ё» (Зюзёнков) встречается реже и, скорее всего, отражает местное произношение, а не смысловое различие.