Фамилия Абабубылов — редкий случай, когда основа настолько необычна, что сразу бросается в глаза. В русской ономастике фамилии, начинающиеся на «Аба-», чаще всего восходят к тюркским корням, но конкретно этот вариант требует отдельного разбора.

Словообразовательная модель здесь стандартная: суффикс -ов (притяжательный, указывающий на принадлежность) и основа Абабубыл. Мужские фамилии на -ов в русском языке образуются от прозвищ, мирских имён или названий профессий. В данном случае основа явно не христианская, а скорее тюркская или арабо-персидская по происхождению.

Наиболее вероятная версия: фамилия образована от личного имени Абабубыл (или близкого к нему варианта). В тюркских языках «аба» может означать «отец», «предок» или «старший родственник», а «бубыл» — искажённое от арабского «бубул» (соловей) или от тюркского слова со значением «ребёнок», «малыш». Таким образом, имя могло быть составным: «старший соловей» (почётное прозвище певца) или «отец ребёнка» (указание на семейное положение).

Вторая, менее правдоподобная версия — связь с диалектным русским словом «абабура» (так в некоторых говорах называли нерасторопного или неуклюжего человека). Но суффикс -ылов в таком случае выглядел бы как -уров (Абабуров), а не -ылов. Поэтому тюркское происхождение основы убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным тюркским влиянием: Поволжье, Южный Урал, Западная Сибирь. Встречается она исключительно редко, что говорит либо о единичном прозвище, либо о поздней фиксации (например, в XIX веке при переписях).

По сословию предки Абабубыловых, скорее всего, были крестьянами или мещанами из смешанных русско-татарских (или башкирских) селений. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано.