Фамилия Абабурко — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, происходит не из славянского, а из тюркского или кавказского языкового мира. Основа «абабур» или «абабурк» не имеет прямого значения в русском или украинском языке, поэтому объяснение приходится искать в соседних языковых семьях. Наиболее правдоподобная версия: в основе лежит тюркское слово «аба» (отец, старший родственник, а также — медведь) в сочетании с «бур» (давать, дарить) или «бурун» (нос). Так прозвище Абабур могло закрепиться за человеком с крупным носом или, в переносном смысле, получить значение «отцовский дар».

Суффикс «-ко» сразу указывает на украинскую или белорусскую почву. В этих языках он работает как указатель на происхождение: Абабурко — буквально «потомок Абабура». В отличие от русских фамилий на «-ов», которые рано закрепились в документах Московского государства, украинские фамилии на «-ко» долго оставались полуофициальными, передавались без изменений в женском роде и нередко фиксировались только в ревизских сказках XIX века.

География фамилии подтверждает её западнорусское происхождение. Абабурко встречается преимущественно на западе и юге Украины, а также в приграничных регионах Беларуси. В России носители — это, как правило, потомки переселенцев конца XIX — начала XX века, которые двигались на восток в ходе столыпинской аграрной реформы и позднее.

Существует и более экзотическая гипотеза: связь с литовским «ababa» (крик, шум) или с древнепрусскими корнями. Но для фамилии, бытующей в славянской среде, тюркская версия выглядит убедительнее: тюркские заимствования проникали в украинские прозвища через казачью среду и прямые контакты с крымскими татарами. Казаки часто получали прозвища по внешним приметам или по поведению, и слово, обозначающее «медведя» или «носатого», здесь вполне уместно.

Предки человека с фамилией Абабурко могли быть казаками или крестьянами, получившими прозвище за внешность или характер. Фамилия не указывает на дворянское происхождение — она из народной среды, где прозвища были конкретными и цепкими, а суффикс «-ко» выдаёт простое сословие и регион.