Фамилия Абертышева — яркий пример того, как редкая фамилия может сохранить в себе забытое слово или прозвище. В основе, скорее всего, лежит неканоническое имя или прозвище Абертыш. Суффикс -ыш в русских прозвищах часто указывал на признак по действию или внешности (ср. Малыш, Голыш, Крепыш). Учитывая, что корень «аберт-» не имеет славянских параллелей, наиболее вероятно тюркское происхождение основы.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское слово «абер» или «абыр» (варианты произношения), которое в диалектах могло означать «осторожный», «опасающийся» или даже «пугливый». Форма Абертыш тогда — это «тот, кто постоянно остерегается», человек с тревожным характером. Менее вероятна, но возможна связь с тюркским «абыр» — «честь, достоинство», тогда прозвище могло означать «гордый, честолюбивый». В любом случае, это прозвище, данное по внутреннему качеству, а не по профессии.

Суффикс -ышев/-ышева в фамилиях встречается нечасто. Он характерен для восточных регионов России (Поволжье, Урал, Сибирь), где активно смешивались русские и тюркские языки. Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Абертыш добавился притяжательный суффикс -ев (в женском роде -ева), указывающий на принадлежность «чей?» — сын или дочь Абертыша. Таким образом, первый носитель фамилии был потомком человека по прозвищу Абертыш.

В написании фамилии есть особенность: начальная буква А. В русских фамилиях исконные основы на А встречаются редко, что ещё раз подтверждает иноязычное происхождение корня. Окончание -а (АбертышевА) указывает на женскую форму фамилии; мужская форма — Абертышев. Фамилия является очень редкой, в базах данных современных телефонов и адресов встречается единично, в основном в центральной России, что может быть следствием миграции из восточных областей в XX веке.