Фамилия Абилаханова — женская форма фамилии Абилаханов, а та в свою очередь — классический пример фамилии, образованной по тюркско-мусульманской модели. Основа здесь — сложное имя Абилахан (вариант написания: Абилхан, Абильхан). Оно состоит из двух арабских корней, прочно вошедших в казахский и другие тюркские языки: «Абил» (от арабского «Абу» — «отец», «обладатель», «владелец») и «хан» (тюркский титул верховного правителя, владыки). Имя Абилахан, таким образом, означает «отец ханов» или, в более переносном смысле, «владыка, подобный хану», «господин». Это имя давали с пожеланием мальчику стать уважаемым, влиятельным человеком, лидером.

Фамилии на -ов/-ев, присоединённые к тюркским именам, — обычное явление для народов, оказавшихся в составе Российской империи и получивших фамилии по русскому образцу. В данном случае к имени Абилахан добавили русский патронимический суффикс -ов, что дало фамилию Абилаханов, а затем и женский вариант с -а. Это говорит о том, что фамилия окончательно оформилась в период, когда фиксация фамилий в документах происходила по русской бюрократической схеме — вероятно, в конце XIX — начале XX века.

Этимологически фамилия тесно связана с ономастикой казахского и каракалпакского народов. Имя Абилахан встречается среди казахов, особенно в западных и южных регионах (Мангыстауская, Атырауская, Кызылординская области). Встречаются и варианты написания через «ь» — Абильханов, что связано с особенностями передачи мягкого звука «л» в арабской графике при записи кириллицей. Оба варианта восходят к одному корню.

Если смотреть на социальный контекст, то обладатели такого имени, как правило, не были простыми кочевниками. Имя с титулом «хан» могло указывать на принадлежность к роду потомственных биев, старшин или людей, пользовавшихся большим авторитетом в ауле. Однако фамилия не обязательно говорит о прямом родстве с ханами — скорее, о том, что предок носил соответствующее имя, которое подчёркивало его амбиции или статус.

В русском языке фамилия склоняется как обычное прилагательное женского рода: Абилахановой, Абилаханову. Ударение, скорее всего, падает на предпоследний слог — АбилахАнова, хотя в разговорной речи возможны колебания.