Фамилия Абоамкина — женская форма фамилии Абоамкин, и её редкость сразу бросается в глаза. В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев или -ин, которые образованы от имён и прозвищ, оканчивающихся на согласный, здесь мы видим нетипичную основу «Абоамк-». Такая структура почти не встречается в русском ономастиконе, и это главная загадка для этимолога.

Скорее всего, в основе лежит не славянское, а иноязычное имя или прозвище. Первая часть «Або-» может восходить к библейскому имени Аввакум (в русской народной форме Абакум) или к арабскому имени Аббас, но в таком случае фамилия должна была бы звучать как Абакумкин или Абасов. Вариант «Абоамкин» явно содержит элемент «ам», который может быть остатком тюркского слова «ам» (лекарство, снадобье) или частью сложного имени. Правдоподобнее всего, что фамилия произошла от еврейского имени Абоам (вариант Авиам), которое в русской среде обросло суффиксом -к(а) (уменьшительно-ласкательная форма), а затем — типичным русским патронимическим суффиксом -ин. То есть Абоамка — уменьшительное от Абоам, а Абоамкин — «сын Абоамки».

Суффикс -ин в фамилии Абоамкина указывает на принадлежность: «чья?» — Абоамкина, то есть дочь или жена человека по прозвищу Абоамка. Такая модель типична для северных и центральных областей России, а также для территорий, где смешивались русские и еврейские общины (например, черта оседлости в XIX веке). Сословно фамилия могла принадлежать мещанам или крестьянам, так как дворянские фамилии с такой необычной основой почти не фиксируются.

Встречаемость фамилии крайне низкая. Поиск по открытым базам данных показывает единичные случаи в России и странах бывшего СССР. Это позволяет предположить, что фамилия могла возникнуть в результате ошибки писаря при записи (например, от Абакумкин или Абоянкин) или же принадлежит одной конкретной семье, сохранившей редкое родовое имя. Однозначно сказать, что означает основа, без архивных записей нельзя, но наиболее рабочая гипотеза — связь с личным именем Абоам (Авиам), которое в русском быту сократили до Абоамка.