Фамилия Аджубей — редкий для русской ономастики случай, когда происхождение почти не вызывает споров, но при этом звучит непривычно. Её основа — тюркское или арабское слово, а географический центр — Крым и причерноморские земли. В основе лежит тюркское «аджу» или «аджы» — горький, кислый, а также горестный, трудный. В арабском есть близкое «аджиб» (удивительный, дивный), но для фамилии правдоподобнее тюркская версия с суффиксом -бей. Бей — тюркский титул, аналог князя или господина. Таким образом, Аджубей — это «горький бей» или «господин горести». Прозвище могли дать человеку с тяжёлой судьбой, суровым нравом или, наоборот, в качестве охранительного имени — чтобы злые силы обходили стороной того, кого уже назвали «горестным».

Модель образования типична для тюркской ономастики: прозвище + социальный титул. Такие составные фамилии встречаются у крымских татар, ногайцев и других народов Северного Причерноморья. Русская фамилия Аджубей — это застывшая форма тюркского личного имени или прозвища, которая перешла в фамилию без дополнительных русских суффиксов (вроде -ов или -ин). Это указывает на то, что носители фамилии либо долго сохраняли тюркскую языковую среду, либо фамилия была записана в документах уже в готовом виде. Отсутствие суффикса — ключевая деталь: фамилия не «обрусела» морфологически, а значит, её зафиксировали в той форме, в какой её произносили сами носители.

В русском контексте фамилия стала широко известна благодаря журналисту и публицисту Алексею Аджубею (зятю Н. С. Хрущёва). Однако корни уходят глубже: в метрических книгах XIX века Аджубей встречается среди караимов и крымских татар, а также у греков Приазовья, где тюркские имена адаптировались к местной среде. Вариантов написания практически нет — фамилия устойчива. Таким образом, Аджубей — это не переосмысленное русское слово, а прямой след тюркского прошлого Крыма и южных степей. Носитель фамилии с высокой вероятностью может проследить свои корни до крымско-татарской или караимской среды, а само имя предка, скорее всего, было горькой шуткой или оберегом.