Фамилия Афицинский — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить случайные или искусственные версии, наиболее правдоподобное объяснение лежит в области польского или западнорусского ономастикона. Суффикс -ский (в польской форме -ski) указывает на дворянское или шляхетское происхождение либо на образование от географического названия. Основа Афицин- может быть связана с польским словом «aficja» — устаревшим обозначением афиши, объявления. Тогда Афицинский — это человек, имеющий отношение к оглашению, объявлению: глашатай, писарь, распорядитель на ярмарке или в суде.

Вторая, менее вероятная версия — от тюркского или арабского имени Афиф (честный, целомудренный) через адаптацию в польской среде. Но для фамилии с окончанием -ский это редкость: обычно такие основы дают фамилии на -ов или -ин. Поэтому версия с польским «aficja» выглядит убедительнее, хоть и не подкреплена массовыми источниками.

Географически фамилия Афицинский почти не встречается в современных базах данных. Единичные носители могут быть потомками мелкой шляхты из бывших земель Речи Посполитой — например, из-под Вильно или Гродно, где такие фамилии фиксировались у обедневших дворян, перешедших в мещанство или крестьянство. В Российской империи фамилию могли получить и семинаристы: при поступлении в духовные училища им часто давали «благозвучные» фамилии по латинским или польским корням. Афицинский могло быть образовано от латинского «affictio» (прибавление, прикрепление) — как намёк на приписанного к приходу.

Словообразовательная модель типична для фамилий, которые не привязаны к конкретному ремеслу или имени, а созданы «по месту» или «по должности». В отличие от массовых Ивановых или Кузнецовых, Афицинский — штучный экземпляр, и его носители, скорее всего, происходят из небольшого круга семей, связанных с канцелярией, церковью или городским управлением на западе бывшей Российской империи.