Фамилия Афтинеско — один из тех случаев, когда географическое происхождение почти очевидно, а вот с корнем слова придётся разбираться. Типичный молдавский или румынский суффикс -еску (в румынской записи -escu), который в русской передаче часто превращается в -еско, сразу указывает на территорию: это юго-запад современной Украины (Бессарабия, исторические области Молдовы) или сама Румыния. В славянских фамилиях такого суффикса нет, так что версия одна: предки носителя фамилии жили в зоне романоязычного влияния.

Сложность в основе Афтин-. В румынском языке есть слово aftă — «афта», то есть язвочка во рту, стоматит. Если это прозвище, то оно могло относиться либо к человеку с проблемной речью или внешностью, либо, что вероятнее, к тому, кто лечил такие болезни. Прямых аналогов в славянских фамилиях от слова «афта» нет, но в румынской ономастике прозвища по болезням и физическим недостаткам — обычное дело (сравните с фамилиями типа Болнав, Шкьоп — «хромой»).

Есть и вторая, более спокойная версия. Основа может восходить к греческому имени Афтиний (Αυθίνιος) или его просторечной форме. Греческое влияние на молдавскую антропонимию XVII–XIX веков было сильным — через церковь и торговлю. В таком случае Афтинеско — это «сын Афтиния», то есть потомок человека, носившего это греческое имя. Правдоподобность этой версии подкрепляется тем, что фамилии на -еску часто образовывались именно от крестильных имён (Ионеску — от Ион, Петреску — от Петре).

Встречаемость фамилии крайне низкая. В современных базах данных России и Украины она фиксируется единично, в основном в Одесской области и Приднестровье — что логично для бессарабской фамилии. Никаких дворянских родов или массового расселения за ней не числится. Скорее всего, это фамилия одного или нескольких крестьянских родов, получивших её от прозвища или имени предка в XIX веке, когда фамилии массово закреплялись за жителями Бессарабии после присоединения к Российской империи.