Фамилия Агекянц — типичный пример армянской родовой фамилии, построенной по модели «имя предка + патронимический суффикс». Суффикс -янц (в старой орфографии — -յանց) указывает на принадлежность к роду: он означает «из семьи такого-то» или «из рода такого-то». Это аналог русского окончания «-ович» или грузинского «-швили», но с акцентом на клановую, а не на личную связь. В армянском языке такое слово называется азганун (ազգանուն) — буквально «имя клана».

Фамилия Агекянц — это вариант более полной формы Агаекянц. Основа — личное имя Агаек. По одной из версий, оно восходит к армянскому словосочетанию, которое переводят как «единственная гора». Такое имя могли дать человеку, жившему у заметной одинокой вершины, или как прозвище, подчёркивающее твёрдость и несгибаемость характера. Соответственно, фамилия Агекянц первоначально значила «из рода Агаека» — то есть потомок того, кого звали Агаек.

Со временем в разговорной речи и при записи фамилий в документах (особенно в XIX — начале XX века, когда Российская империя фиксировала армянские фамилии по слуху) произошло упрощение: «Агаекянц» превратилось в «Агекянц». Выпадение гласного «а» в начале — естественный процесс для живой речи, когда длинное имя сокращается для удобства произношения.

Фамилия Агекянц распространена среди армян, чьи предки жили в Западной Армении (территория современной восточной Турции) и в регионах исторической Киликии. После геноцида армян 1915 года носители фамилии рассеялись по диаспоре — их можно встретить в Армении, России, США, Франции и Ливане.

Поскольку процесс формирования армянских фамилий был длительным и не всегда документированным, окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Агаекянц можно лишь на основании глубоких генеалогических исследований — например, по церковным метрическим книгам или османским налоговым реестрам. Но сама модель образования фамилии (имя + -янц) уверенно относит её к древнему пласту армянской ономастики, сложившемуся ещё в средневековье.