Фамилия Агнисенкова — женская форма фамилии Агнисенков, и её разбор стоит начать с редкого и неочевидного корня. Основа «Агнис-» сразу вызывает вопросы: это не крестильное имя (в святцах нет Агниса), не географическое название и не очевидное прозвище. Скорее всего, перед нами результат народной переработки канонического имени Агния или Агнесса. В бытовой речи XIX века имя Агния могли произносить как «Агниса» — с твёрдым окончанием, по аналогии с десятками женских имён на -иса (Ириса, Аниса). От этой народной формы «Агниса» и образовали отчество или прозвище: сына или внука Агнисы называли «Агнисенок» (по той же модели, что «Иванёнок» от Ивана). Суффикс -енк- в русских фамилиях — типично украинский и южнорусский признак, указывающий на происхождение из малороссийских или пограничных с Украиной губерний (Белгородская, Курская, Воронежская, Харьковская). Агнисенков — буквально «потомок Агнисы». Фамилия встречается в основном в центрально-чернозёмных областях России, в документах переписей XIX века её фиксируют среди крестьян и мещан — сословно это не дворянская, а простонародная фамилия. Интересна параллель с фамилией Агнивцев: та образована от редкого имени Агнив (возможно, из греческого «агнос» — чистый), но Агнисенков — точно не от него, здесь суффикс -енк- однозначно отсылает к женскому имени. Если ваш предок носил фамилию Агнисенков, он почти наверняка был выходцем из семьи, где бабушку звали Агниса, и это имя закрепилось в родовом прозвище.