Фамилия Акчаганова образована от тюркского мужского имени или прозвища Акчаган. Разбираем её по составу: основа делится на два корня — «ак» («белый», «чистый») и «чаган» (вариант тюркского «чага» — «ребёнок», «дитя»). Вместе получается «белое дитя» или «светлый ребёнок». В переносном смысле так могли назвать долгожданного, любимого или светлолицего младенца — имя-оберег или имя-пожелание.

Суффикс «-ов» делает фамилию патронимической: Акчаганов буквально значит «сын Акчагана». Женская форма Акчаганова — это либо дочь, либо жена человека с такой фамилией. По модели образования это типичная русская фамилия, но с нерусской основой. Такие фамилии массово закреплялись за татарскими, башкирскими, казачьими и кавказскими родами в XVIII–XIX веках, во время ревизий и переписей, когда требовалось записать фамилию по отцу.

Встречается и вариант Акчаганов (без конечной «а»), но форма на «-ова» распространена шире, так как передаётся по женской линии. Стоит обратить внимание на ударение: в большинстве говоров оно падает на третий слог — Акчага́нова, хотя в местах компактного проживания носителей возможны местные варианты.

С точки зрения сословной принадлежности, Акчагановы могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, особенно в казачьих областях, где фамилии тюркского происхождения не редкость. Прямых указаний на дворянство нет, но это не исключает принадлежности отдельных ветвей к мелкопоместному или однодворческому сословию.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, Акчаганов стоит в одном ряду с Чагиным, Акчуриным, Аксаковым. Все они построены по одной словообразовательной схеме, но основа «чаган» здесь редкая, что делает фамилию узнаваемой и не слишком распространённой. В современных базах данных она фиксируется в единичных случаях по России и странам СНГ.