Фамилия Ахмадхужаев — сравнительно поздняя и редкая для России, её корни ведут в Среднюю Азию, в первую очередь в Узбекистан. В основе лежит сложное арабско-персидское имя Ахмадхужа, которое состоит из двух частей. Первая часть, Ахмад, — одно из имён пророка Мухаммеда, в переводе с арабского означает «достохвальный» или «восхваляющий Бога». Вторая часть, Хужа (от персидского «хваджа»), означает «господин», «хозяин», «наставник» или «купец». В дореволюционной Средней Азии «хожа» (или «ходжа») — это не просто обращение, а указание на социальный статус: так называли потомков исламских проповедников или крупных торговцев. Полное имя Ахмадхужа можно перевести как «достохвальный господин» или «господин Ахмад».

Модель образования фамилии — восточная, с русским суффиксом -ев. В русской паспортной системе, которая распространилась на Туркестан в конце XIX — начале XX века, фамилии от имён отцов часто оформляли по тому же принципу, что и в метрополии: основа (имя отца) плюс суффикс принадлежности. Так Ахмадхужа превратился в Ахмадхужаев — «сын Ахмадхужы». Интересно, что в самом узбекском языке аналогичная фамилия звучала бы как Ахмадхужаев или Ахмадхўжаев, а в таджикском — как Ахмадхуджаев. Русское окончание -ев закрепилось в документах при записи в загсах и военкоматах.

Географически фамилия сосредоточена в Узбекистане, Таджикистане и среди диаспор из этих стран. В России носители живут в основном в крупных городах — Москве, Санкт-Петербурге, а также в регионах с историческими связями со Средней Азией, например, в Татарстане или Башкортостане. Встречается она редко, поэтому её легко спутать с похожими фамилиями: Ахмадходжаев, Ахмедходжаев или Ахматхужаев. Разница в написании — следствие разной транслитерации арабских и персидских звуков через русский алфавит.

Социальный контекст фамилии говорит о том, что предок носителя был человеком уважаемым — либо религиозным авторитетом (потомком ходжей), либо состоятельным купцом. В узбекской и таджикской традиции фамилии на -ходжа, -хужа, -худжа часто указывали на принадлежность к духовному сословию, хотя к советскому времени это значение стёрлось. Сегодня Ахмадхужаев — просто фамилия, которую носят люди самых разных профессий, от врачей до предпринимателей.