Фамилия Ахмаджанов происходит от составного мужского имени Ахмаджан, которое в тюрко-персидской среде складывается из двух смысловых частей. Первая — Ахмад, арабское имя, означающее «достойный похвалы», «прославленный»; в исламской традиции это один из эпитетов пророка Мухаммада, и оно же несёт значение «верящий в единого Аллаха, мусульманин». Вторая часть — джан (или жан), персидское слово «душа», которое в составе имён часто выражает ласку, близость или принадлежность. Вместе имя Ахмаджан можно перевести как «душа мусульманина» или «душа, прославляющая Аллаха».

Фамилия образована по русской словообразовательной модели: к основе Ахмаджан прибавлен суффикс -ов, типичный для фамилий на территории бывшей Российской империи, особенно среди народов, принявших русское делопроизводство. Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был татарином, башкиром или представителем другой тюркоязычной группы, жившим в контакте с русскоязычной администрацией — в Поволжье, на Урале или в Средней Азии. Суффикс -ов здесь не несёт значения принадлежности к отцу в прямом смысле, а служит формальным маркером фамилии, закреплённым в документах XIX–XX веков.

В отличие от многих фамилий, которые со временем теряют связь с исходным значением, Ахмаджанов сохраняет прозрачную этимологию. Интересно, что имя Ахмаджан в советский период нередко сокращалось в быту до Ахмад или Жан, но в официальных записях фамилия закрепилась именно в полной форме. Географически фамилия чаще всего встречается в Узбекистане, Таджикистане, а также среди татарской диаспоры в России. Встречаются варианты написания с одной «н» (Ахмаджанов) и с двойной (Ахмаджанов), что связано с особенностями передачи арабской вязи кириллицей в разных регионах.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — например, Ахмадов, Ахмедов, Ахмадиев, — то Ахмаджанов стоит особняком: двойная основа с компонентом «джан» выдает традицию составлять имена из двух значимых корней, характерную для персоязычного и тюрко-персидского пограничья. Таким образом, фамилия не просто называет предка по имени, а сохраняет фрагмент культурного кода: уважение к религии и поэтическое отношение к имени как к «душе» человека.