Фамилия Ахнишева — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Проще всего было бы связать её с тюркским корнем «ахун» (духовное лицо, мулла у мусульман), но суффикс -ишев указывает на иную словообразовательную модель.

Разбираем по составу: основа Ахниш- и суффикс -ев (женская форма — -а). Суффикс -ев типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён на мягкий согласный. А вот Ахниш — это, скорее всего, не полное имя, а прозвищная форма. В русских говорах и в ономастике известна модель, когда к имени или прозвищу добавляли уменьшительно-пренебрежительный суффикс -ыш (ср. Малыш, Голыш, Крепыш). Отсюда Ахниш могло возникнуть как вариант имени Ахмет, Ахун или даже Афанасий (в просторечии — Ахоня, Ахниш). То есть Ахнишевы — это потомки человека, которого в быту звали Ахниш, а в официальных документах записали по отчеству: «чей?» — Ахнишев.

Другая, менее вероятная версия, — связь с диалектным словом «ахнуть» (ударить, стукнуть) или «ахниться» (испугаться). В этом случае прозвище Ахниш мог получить человек суетливый или, наоборот, неожиданно резкий в движениях. Однако такие прозвища обычно фиксируются в форме глагольных основ (Ахай, Ахальник), а суффикс -ыш для них нехарактерен.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием — Поволжье, Приуралье, юг России. Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении, возможно, от одного родоначальника в конкретном селе или уезде. Сословно носители фамилии могли быть как крестьянами (чаще всего), так и мещанами.

Если коротко: Ахнишева — это «дочь Ахниша», а сам Ахниш, скорее всего, ласкательное или уменьшительное от имени Ахмет или Афанасий. Фамилия показывает, как в русской среде адаптировали иноязычные основы, переоформляя их по законам русской грамматики.