Фамилия Ахтаханова, как и большинство восточных фамилий, ведет начало от личного Ахтахан, которое имеет сложную структуру и состоит из двух частей. Первая из них - «ахта» - скорее всего, восходит к древнетюркской основе «ахта» со значением «звезда» (в переносном значении «счастье»). По другой версии, компонент «ахта» связан с арабским именем Ахтям, которое переводится как «щедрейший из щедрых». Вторая часть имени - тюркский компонент «хан» - означает «хан, повелитель, владелец, хозяин, правитель». Имена, в состав которых входит слово «хан», на Востоке нередко давались мальчикам с пожеланием ребёнку ханской власти и богатства. Таким образом, имя Ахтахан означает «щедрый повелитель» или «хан, родившийся под счастливой звездой». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ахтахановых можно лишь на основании генеалогических исследований.