Фамилия Алесеева образована по самой распространённой русской модели — как притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чья?». Она означает «дочь или жена человека по имени или прозвищу Алесей». Основа фамилии напрямую связана с именем Алексей, но с утратой начального «к». В живой речи XVII–XVIII веков, особенно в северных и центральных русских говорах, редукция первого слога была обычным явлением: Алексеев сначала превращался в Алексеев, а затем и в Алесеев. В переписных книгах тех лет встречаются крестьяне, записанные как «Алесейко», что подтверждает разговорное усечение полного имени.

Существует и другая, более редкая версия происхождения. В некоторых говорах «алесей» называли человека, который «алесит» — говорит невнятно, бормочет или путает слова. Такое прозвище могли дать заике или просто неразговорчивому крестьянину. Эта версия менее вероятна, но имеет право на существование, поскольку прозвища по речевым особенностям в русской ономастике встречаются часто.

Суффикс -ев указывает на патронимическую модель: фамилия образована от отчества или прозвища, заканчивающегося на -ей. В отличие от фамилий на -ов, которые крепче держатся за твёрдые основы, -ев чаще встречается у мягких и шипящих окончаний. Если бы фамилия произошла от полного имени Алексей, мы бы ожидали форму Алексеев, но редукция начального слога дала вариант Алесеев, который закрепился в документах.

Географически фамилия Алесеева встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда. Её носители есть и в бывших великорусских губерниях, и на Урале. Это говорит скорее о случайном закреплении прозвищной формы, чем о массовом роде. Социальный контекст, скорее всего, крестьянский или мещанский: в дворянских родословных книгах такая фамилия не фиксируется. Предки были людьми податного сословия, чьё прозвище закрепилось при переписи.

Фамилия почти не имеет однокоренных «конкурентов»: Алесов, Алесин, Алесев — все они редки. Это делает Алесееву не просто вариантом распространённого Алексеева, а самостоятельной ветвью, где утрата звука стала не ошибкой писаря, а сознательным бытовым именем. В современном русском языке фамилия сохраняет архаичный оттенок, напоминая о тех временах, когда имя и прозвище могли сливаться в одно, а буква «к» исчезала без следа.