Фамилия Алигорский звучит не по-русски, а суффикс -ский сразу намекает на дворянское или географическое происхождение. Но перед нами, скорее всего, искусственная фамилия — книжная, а не бытовая. В русской ономастике суффикс -ский чаще всего привязывает фамилию к местности (топонимические фамилии) или к семинарскому прошлому, когда будущим священникам давали звучные фамилии по латинским и греческим корням.

Главная версия — от греческого «алегорос», то есть «говорящий иносказательно». Отсюда и «аллегория». Семинаристы, получавшие фамилии по риторическим фигурам или богословским понятиям, нередко становились Аллегорийскими или Аллегориновыми, а со временем написание упростилось до Алигорского. Потеря одной буквы «л» в фамилии — обычное дело: при записи в метрических книгах писарь мог сократить громоздкое слово, чтобы оно звучало привычнее для русского уха.

Альтернативная версия — связь с географическим названием. В Польше и на Западной Украине встречаются топонимы вроде Алигора или Алигоры, но они крайне редки и не зафиксированы в известных справочниках. Если бы фамилия была польской, она чаще писалась бы через «ж» (Alegorski) или имела бы характерный суффикс -ович. Поэтому семинарское происхождение убедительнее: фамилия «кабинетная», а не уличная.

Словообразовательно фамилия прозрачна: основа Алигор- (от аллегория) + суффикс -ск- + окончание -ий. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: АлигОрский. Вариант с ударением на третий слог противоречит логике русского словообразования, где суффикс -ский обычно безударный. Значение исходного прозвища — «иносказательный», «относящийся к аллегории». Для семинариста это был знак образованности и владения риторикой.

Социальный контекст: носители фамилии Алигорский в XIX — начале XX века с большой вероятностью принадлежали к духовному сословию или к обедневшим дворянам, получившим фамилию по месту службы или учебы. Встречаемость фамилии низкая, она не входит в сотни самых распространенных — это подтверждает её искусственный, а не крестьянский характер. Если ищете предков-священников, имеет смысл смотреть по епархиям Центральной России и Поволжья: там семинарские фамилии давали особенно охотно.