Фамилия Алимсултанова — редкий пример, когда в основу легло составное мужское имя Алимсултан, собранное из двух арабских слов: «Алим» (знающий, учёный, один из эпитетов Аллаха) и «Султан» (властитель, правитель). В тюркской и кавказской ономастике такие двойные имена были распространены у народов, принявших ислам, и несли пожелание ребёнку сочетать мудрость с властью. Интересно, что подобное соединение двух имён или титулов в одну основу — нечастая модель: она встречается реже, чем фамилии от одного корня, и сразу выделяет носителя среди прочих.

Суффикс -ов- (в женском варианте -ова) указывает на русскую модель оформления, которая в XIX–XX веках стала стандартной для народов Северного Кавказа, Закавказья и Поволжья. При взаимодействии с российской административной системой нерусские фамилии часто получали этот патронимический суффикс, чтобы вписаться в общий документооборот. Таким образом, Алимсултанова буквально означает «дочь (или потомок) Алимсултана».

Географически фамилия почти наверняка указывает на чеченское или кумыкское происхождение. У чеченцев имя Алимсултан встречается в родовых именах (тейпах), а у кумыков бытует как традиционное сложное имя. Встречается она и у аварцев, и у ингушей, но реже. Разбор по национальным корням здесь точнее, чем попытка искать арабские или тюркские корни напрямую: имя арабское, а фамилия — результат местной, кавказской, традиции имянаречения.

Двойные имена такого типа нередко давали в знатных семьях — чтобы подчеркнуть высокий статус рода. Однако Алимсултан могло быть и просто личным именем, без сословной нагрузки. В отличие от фамилий на -ский или -ин, эта фамилия не имеет географической привязки к русским землям, и её носители почти наверняка связаны с историей Чечни или Дагестана.