Фамилия Алсыев — редкий случай, когда основа почти наверняка не славянская, а тюркская. Суффикс -ев указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на -й. В данном случае исходное имя или прозвище звучало как Алсый.

Самая вероятная версия — происхождение от тюркского мужского имени Алсы. В тюркских языках корень «ал» часто связан с понятиями «брать», «взять», «владеть», но в именах он мог приобретать значение «сильный», «могучий» или даже «красный» (как символ власти и статуса). Имя Алсы могло быть как личным, так и прозвищным. В русской среде, особенно в регионах активного контакта с татарами, башкирами или чувашами (Поволжье, Приуралье), такие имена адаптировали: Алсый — Алсыев.

Менее убедительна версия о связи с диалектным русским словом. В некоторых говорах «алсы» или «алсый» не зафиксировано. Если бы основа была славянской, скорее всего, мы бы увидели фамилию Алсов или Алсин, а не Алсыев. Форма с суффиксом -ев и мягким окончанием как раз характерна для русификации тюркских имен на -ы, -и.

География фамилии подтверждает эту догадку. Алсыевы встречаются в Чувашии, Татарстане, Башкортостане и соседних областях. Это типичный ареал, где русские фамилии образовывались от местных дохристианских имен. Носители фамилии, скорее всего, потомки крещёных татар, чувашей или башкир, перешедших в православие в XVI–XVIII веках. При крещении им давали церковное имя, но в быту и в документах долго держалось старое родовое прозвище, которое и закрепилось как фамилия.

Словообразовательная модель проста: Алсый (основа) + -ев (притяжательный суффикс). Буквально: «сын Алсого», «из рода Алсых». Никаких сложных морфологических наслоений нет. Фамилия не дворянская и не купеческая — она из крестьянской или посадской среды, где до середины XIX века фамилии часто не были закреплены окончательно и могли писаться по-разному (Алсыев, Алсыев). Сегодняшняя орфография с буквой «ы» — результат поздней унификации.