Фамилия Алуксеева — один из тех редких случаев, когда написание расходится с привычным звучанием. На слух она почти неотличима от распространённой фамилии Алексеева, но буква «у» во втором слоге меняет всю историю. Скорее всего, перед нами не самостоятельный корень, а диалектный или бытовой вариант произношения имени Алексей. В северных и некоторых центральных говорах русский язык «окал» и «ужал» гласные: имя Алексей в просторечии могло звучать как Олексий, Олексей, а в отдельных местностях — как Алуксей. Фонетический переход «е» в «у» под влиянием лабиализации (огубления) встречается в народной речи, особенно в сочетании с плавным «л»: язык как бы округляет гласный, чтобы было удобнее произнести. Так и закрепилась форма Алуксеев — сначала как отчество или прозвище, а потом как фамилия.

Суффикс -ев указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — Алуксеев, то есть сын Алуксея. Это типичная для XVI–XVII веков схема, когда фамилии образовывали от крестильного имени отца. Имя Алексей (от греческого «защитник») было одним из самых популярных на Руси, поэтому вариантов его народной переделки множество: Алексеев, Олексеев, Лексеев, а также Алуксеев. Последний — самый редкий, он почти не встречается за пределами определённых регионов. Если судить по географии современных носителей, фамилия тяготеет к северо-западу России: единичные записи есть в Вологодской, Архангельской областях и в Карелии. Это косвенно подтверждает версию о северном говоре, где «оканье» и замена гласных были особенно сильны.

Другая, менее вероятная версия связывает фамилию с тюркским или финно-угорским корнем. В некоторых языках Поволжья есть слова, похожие на «алук» (например, в марийском «алук» — «овраг» или «ложбина»). Однако для русского ономастикона такая основа нетипична, и фамилия Алуксеева не фиксируется в татарских или башкирских родословных. К тому же суффикс -ев — однозначно русский, а не тюркский. Поэтому версия с искажением имени Алексей остаётся основной и наиболее логичной.

Таким образом, предки носителя фамилии Алуксеева — это, скорее всего, крестьяне или посадские люди из северных русских земель, записанные в документах по отцу Алуксею. Сама фамилия — живое свидетельство того, как местное произношение меняло привычные имена, превращая их в редкие и узнаваемые родовые прозвания.