Фамилия Аматоков — редкая, её носителей в России буквально единицы. Чтобы разобраться в её происхождении, стоит начать с основы «Аматок». Она явно не славянская, а скорее тюркская или кавказская. В тюркских языках существует имя Амат — местная форма арабского Ахмад, что значит «достохвальный». Формант -ок в таком случае выполняет роль уменьшительного или ласкательного суффикса: Аматок — это «маленький Амат» или, по другой логике, «сын Амата». Сама фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, что характерно для регионов, где русское делопроизводство фиксировало местные имена и прозвища.

Кавказская версия тоже заслуживает внимания, хотя она менее надёжна. В осетинском языке есть слово «амата» — «ветви» или «род», и суффикс -ок мог появиться при адаптации фамилии в русских документах. Но в осетинской традиции фамилии обычно оформляются суффиксами -ты или -ти, а не -ов, поэтому такое объяснение уступает тюркскому. Скорее всего, перед нами пример фамилии, возникшей в среде тюркоязычных народов — например, у татар или балкарцев, — которые после вхождения в состав Российской империи получили русское окончание.

Географически фамилия Аматоков встречается на Северном Кавказе, особенно в Кабардино-Балкарии, и в южных регионах России. Это подсказывает, что предки носителя, вероятно, были крестьянами или горцами, не принадлежавшими к дворянству. Фамилии на -ов от прозвищ и уменьшительных имён были массовыми у простонародья: в отличие от аристократических родовых имён, Аматоков не указывает на владение землёй, а лишь фиксирует личное имя или прозвище родоначальника.