Фамилия Аматунян — армянская по происхождению, и это сразу слышно по её окончанию. Суффикс -ян (в старой орфографии — -янц) — один из самых распространённых патронимических показателей в армянском языке. Он означает принадлежность к роду или потомка: Аматунян буквально переводится как «из рода Аматуна» или «потомок Аматуна». В отличие от русских фамилий, где суффикс указывает на отца (Иванов — сын Ивана), армянский -ян может восходить как к личному имени, так и к прозвищу основателя рода.

Основа фамилии — Аматун. Это древнеармянское мужское имя, которое встречается ещё в раннесредневековых источниках. Этимология имени прозрачна: оно образовано от слова amat («сильный», «мужественный», «доблестный»). В армянском языке существует и прилагательное amatun с тем же значением. Таким образом, имя Аматун — это пожелательное или характеризующее имя, которое могли дать мальчику в надежде, что он вырастет крепким и смелым.

Интересная деталь: в армянской ономастике имя Аматун не стоит путать с фамилией Аматуни. Разница в одну букву — не случайность. Аматуни — это фамилия, которая принадлежала известному армянскому княжескому роду, восходящему к династии Мамиконянов. Но в случае с Аматунян мы имеем дело не с аристократическим титулом, а с массовой моделью образования фамилий от личного имени. Аматунян — фамилия более демократичная: её носителями были, скорее всего, ремесленники, крестьяне или священнослужители, чей предок носил имя Аматун.

Географически фамилия Аматунян чаще всего встречается в исторической Западной Армении (ныне восточные районы Турции) и в регионах, куда переселились армяне после геноцида 1915 года — на территории современной Армении, в Грузии, Краснодарском крае и Ростовской области России. В диаспоре фамилия распространена в США, Франции и Ливане.

В написании возможны варианты: в русской передаче фамилия закрепилась как Аматунян, хотя в армянском оригинале (Ամատունյան) ударение падает на последний слог. Если встречаете написание «Аматуньян» — это ошибка, вызванная ложной аналогией с русскими фамилиями на -ин (типа Марьин). Правильный вариант — с одной «н» и мягким знаком только в том случае, если он стоит перед «я»: Аматунян.