Фамилия Аматунянц интересна уже тем, как она записана. В России армянские фамилии чаще всего оканчиваются на -ян, более привычное уху окончание. Аматунянц же сохранила старую форму на -янц — это показатель множественного числа в древнеармянском родительном падеже. Такое окончание указывало на принадлежность к целому роду или дому: буквально фамилия означает «из рода Аматунов» или «принадлежащий к семье Аматун».

Основа фамилии — Аматун. В армянском языке «аматун» переводится как «ремесленник» или «мастеровой человек». Слово происходит от корня «амат» (арм. հմուտ — умелый, искусный) с суффиксом принадлежности -ун. То есть прозвище Аматун давали человеку, который владел каким-либо ремеслом — кузнечным, гончарным, плотницким. Со временем это прозвище закрепилось как родовое имя, а затем перешло в фамилию.

Форма на -янц (встречается также написание Аматунц) характерна для западных диалектов армянского языка. В восточноармянском варианте та же фамилия звучала бы как Аматунян. В XIX веке, когда российские чиновники массово фиксировали армянские фамилии в метрических книгах, они часто записывали их именно с окончанием -янц или -ов, закрепляя диалектное произношение. Поэтому географически фамилия Аматунянц чаще всего встречается среди армян, переселившихся в XIX веке из Западной Армении (территории современной Турции) и осевших на Кубани, в Крыму или на юге России.

В дореволюционных записях Екатеринодара и Ростова-на-Дону можно найти упоминания о мещанах и купцах с этой фамилией — ремесленниках, которые сохранили своё родовое прозвище в диалектной форме. Сословная принадлежность у носителей фамилии была разной: от городских ремесленников до духовенства, но никогда не была крестьянской — в армянской среде фамилии на -янц чаще носили горожане и торговцы.